Dalam perangkat lunak Quartus® II versi 6.1, file .pin salah menunjukkan nilai pin daya VCCA berdasarkan standar I/O Bank1. Misalnya, jika Anda menetapkan standar I/O HSTL kelas II 1.5V ke pin di Bank1, file .pin menunjukkan 1,5V untuk pin VCCA. Nilai pin VCCA harus 3,3V dan tidak bergantung pada standar I/O Bank1.
Masalah ini telah diperbaiki dimulai dengan perangkat lunak Quartus II versi 7.0.
Untuk mengatasi masalah di perangkat lunak Quartus II versi 6.1, instal patch yang sesuai dari daftar berikut: