Perangkat lunak Quartus® II versi 9.1 mungkin salah menghasilkan file pemrograman untuk desain yang menargetkan perangkat EP2AGX45 dan EP2AGX65 Arria® II GX. Masalah ini dapat terjadi ketika Anda memprogram perangkat Anda dengan Quartus II Programmer atau menggunakan format file berikut: .pof, .rbf, .hexout, .ttf, .rpd, .jic, .jam, .jbc, dan .svf. Masalah ini menyebabkan kegagalan fungsional pada beberapa perangkat setelah pemrograman.
Untuk mengatasi masalah ini untuk perangkat lunak Quartus II versi 9.1 unduhan dan instal patch yang sesuai dari tautan di bawah ini, kemudian regenerasi file pemrograman yang diperlukan dan memprogram ulang perangkat. Perhatikan bahwa berkas .sof yang dibuat selama kompilasi tidak terpengaruh, sehingga tidak diperlukan kompilasi ulang. Masalah ini akan diperbaiji dalam versi perangkat lunak Quartus II di masa mendatang.