Karena masalah dalam perangkat lunak Quartus® II versi 11.1 SP2 dan sebelumnya, model simulasi Stratix® V PLL yang salah dapat menyebabkan frekuensi output PLL menunjukkan nilai frekuensi output yang lebih tinggi dari yang diharapkan jika Anda memiliki dua atau lebih megafungsi Altera_PLL independen di testbench Anda.
Masalah ini telah diperbaiki dimulai dengan perangkat lunak Quartus II versi 12.0.