Perangkat lunak Quartus® II versi 6.1 dan 7.0 menghapus penugasan global ke clock transiver ketika saluran transiver digabungkan, sehingga beberapa clock dapat ditetapkan ke rute lokal. Perangkat lunak Quartus II harus mempromosikan clock transceiver ke rute clock global atau regional.
Masalah ini telah diperbaiki dimulai dengan perangkat lunak Quartus II versi 7.1.
Atau untuk mengatasi masalah ini di perangkat lunak Quartus II versi 6.1, instal patch yang sesuai dari daftar berikut: