Perangkat lunak Quartus II memerlukan direktori yang berisi ModelSim yang dapat dieksekusi seperti vlog, vcom, dan vsim untuk berada dalam variabel lingkungan PATH.
Misalnya, variabel PATH harus mencakup direktori berikut untuk perangkat lunak ModelSim SE dan alat ModelSim-Altera pada platform PC:
\win32 \win32aloem