Nios® II IDE memanggil Pembangun SOPC selama operasi tertentu, yang dapat menyebabkan Pembangun SOPC mengubah stempel tanggal file PTF meskipun sistem tidak dimodifikasi. Perilaku ini dapat menyebabkan masalah jika Anda menggunakan sistem kontrol versi.
Untuk mengatasi masalah ini, Anda dapat mengubah properti file PTF menjadi read-only untuk mencegah Nios II IDE mengubah berkas. Namun, Anda memerlukan izin tulis baca untuk berkas PTF jika Anda menggunakan Nios II Compiler C2H.