Jika Anda saat ini tidak menggunakan Quartus II 3.0 Service Pack 1 dan Nios 3.1, Anda harus meningkatkan ke versi perangkat lunak ini. Selanjutnya, instal ulang driver parport2000 dengan mengetik perintah ini di prompt DOS atau dari Nios SDK Shell:
1. cd ke direktori driver parport2000 yang terletak di /altera/kits/nios/bin/fs2/bin/
2. ketik "psetup /q" untuk menginstal driver
Anda kini dapat melakukan debug Nios sistem menggunakan inti OCI dengan perintah nios-debug.