Dalam beberapa kasus, ISS tidak mengabaikan pembacaan memori yang tidak terinisialisasi, bahkan ketika "Pembacaan memori tidak terinisialisasi" diatur ke "Abaikan" pada tab Pengaturan ISS pada konfigurasi jalankan di Nios® II IDE.
Untuk mengatasi masalah ini, Anda dapat menggunakan Lauterbach Nios II ISS.